Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms