Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN2AQ12879 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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