Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RUNX1T1Q06455 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms