Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CD164Q04900 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
CD164Q04900 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms