Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms