Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HBBP68871 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HBBP68871 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HBBP68871 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HBBP68871 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms