Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ACTA2P62736 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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