Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPZ1P61923 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms