Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EEFSECP57772 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms