Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLDN8P56748 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLDN8P56748 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms