Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH3BGRP55822 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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