Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA1P46926 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms