Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms