Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCGF2P35227 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms