Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPS1P31327 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPS1P31327 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms