Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCAP28676 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCAP28676 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCAP28676 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms