Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDK11BP21127 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK11BP21127 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms