Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COX4I1P13073 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COX4I1P13073 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms