Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN1P12814 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms