Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RALAP11233 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RALAP11233 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RALAP11233 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RALAP11233 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms