Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPLO60437 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPLO60437 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPLO60437 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PPLO60437 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms