Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SETD1AO15047 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms