Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APAF1O14727 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms