Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HELTA6NFD8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HELTA6NFD8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms