Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
A4D1N5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
A4D1N5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms