Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms