Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KDM5BQ9UGL1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms