Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RDH8Q9NYR8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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