Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms