Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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