Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms