Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLDIP3Q9BY77 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms