Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms