Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC7Q96M83 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms