Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM4SF19Q96DZ7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM4SF19Q96DZ7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms