Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EME1Q96AY2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms