Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RABGGTAQ92696 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RABGGTAQ92696 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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RABGGTAQ92696 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RABGGTAQ92696 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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