Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGCDQ92629 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms