Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BHLHE22Q8NFJ8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms