Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDCL2Q8N4E4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms