Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEST3Q8N1M1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms