Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
WDR53Q7Z5U6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms