Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV89

SH2D5, SH2 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D5Q6ZV89 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH2D5Q6ZV89 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms