Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GARNL3Q5VVW2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms