Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C10orf55Q5SWW7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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C10orf55Q5SWW7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
C10orf55Q5SWW7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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