Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PERM1Q5SV97 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1003.1 ms