Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS13

RALGPS1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor RalGPS1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1Q5JS13 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RALGPS1Q5JS13 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms