Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC25A52Q3SY17 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms