Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
Q1T7F1 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Q1T7F1 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Q1T7F1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
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