Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms